由中心首席科学家提名1名专家负责该室的业务工作，进行技术指导与把关。在协作交流处协调下，开展如下工作：
1．执行重大动物疫病及紧急疫情流行病学调查。
2．开展国内动物疫病区域风险分析与评估工作，参与外来动物疫病风险分析评估工作。
3．收集国内动物卫生信息，建设和维护国家动物卫生与流行病学数据库。
4．开展重大动物疫病分析预警工作和流行规律研究，起草重大动物疫病流行病学分析报告。
5．开展动物疫病流行病学方法研究，提供技术指导。
6．完成中心领导交办的其他工作。